男性青春期保健，主要是指正确对待与处理生殖器官的卫生保健以及遗精、包皮过长、包茎、隐睾等现象。
男孩子在幼年时，阴茎的包皮会将阴茎头盖住。随着青春发育的开始，阴茎上的包皮会逐渐向上退缩，慢慢露出龟头。在这一变化过程中，阴茎头部冠状沟相当容易囤积赃物，形成白色甚至紫黑色的“包皮垢”。包皮垢是细菌的良好培养基础，它很容易导致包皮和阴茎头发炎，所以应该养成经常清洗阴茎和阴部的习惯。在清洗时，将包皮往上推送，露出龟头，然后用手指合着肥皂和清水慢慢地清洗，为保持外生殖器的清洁，应该经常更换衬裤。衬裤布料最好选用透气性强的纺织品。衬裤要略微宽松一些。
还应注意在运动状态下对睾丸的保护。睾丸是身体的重要器官，十分脆嫩，又因为露在体外比较容易受到伤害。所以，在嬉戏运动过程中，要随时注意保护自己的生殖器官，同时注意千万不要去踢打他人的下身。
睾丸正常的位置是在阴囊内，如果阴囊内无睾丸或缺一只睾丸，就称为“隐睾症”。隐睾是男孩中的一种先天性畸形。患者中要能够尽早得到治疗，仍可与同龄男性一样健康发育。
遗精是“精满自溢”的正常现象。常常发生在夜里做梦的时候，所以也称“梦遗”。在清醒的时候发生的遗精称为滑精。两者无本质区别。有些青少年对遗精现象不了解，误以为会影响健康，产生了一些焦虑，其实是完全不必要的。
有一些青少年遗精频繁，一两天一次或一天数次，那就有些不正常了。其主要原因：一是受到社会上不良的或者不适合青少年的性信息的刺激，如受淫秽书刊、影像的影响，常常沉浸在性幻想中;二是生殖器官局部受到不良影响，如包度过长、尿道炎、前列腺炎等炎症刺激;三是生殖器管因内裤太紧受摩擦刺激或睡觉时被子盖得太厚;四是玩弄自己的生殖器。只要认真纠正这些不良的行为，或是经医生诊治有关疾患，一般能够解决遗精频繁的问题。
包皮过长与包茎：包皮过长是指包皮在任何状态下遮盖住全部阴茎头。包茎是指包皮很紧，包皮口小而且无伸缩性，不能以任何方法使包皮退缩并露出龟头。男孩在青春发育之前，包皮盖住龟头全属正常现象。随着发育开始，阴茎逐渐增大，包皮会慢慢向后退缩，露出部分或整个阴茎头。这个过程需要的时间比较长，因为男孩一般到18-25岁才能发育完善。在此期间，只要经常清洗阴茎，保持包皮囊内的清洁，不让冠状沟处生出包皮垢，那么包皮长些完全没有必要多加忧虑。
至于包茎，青少年中的大多数包茎现象属假性包茎，主要由于从来没有翻开包皮，洗过龟头，致使包皮与龟头粘连，或因被包皮垢抵住，包皮无法往上推送。处理的方法是，养成经常清洗阴茎的卫生习惯，在清洗时往上牵拉包皮，包皮口会逐渐变得宽松。如果是真性包茎，则需要请医生诊治。