1、恶心和头痛
疱疹病毒最常见的副作用是恶心和头痛，感染的女性总是经常发现同样的抱怨，即使在疾病的治疗。
2、疱疹会导致大脑疾病
已经两次发现女性比男性更容易受到HSV感染，女性患有疱疹感染也被诊断出患有脑部疾病，称为脑炎。这是一种罕见的大脑疾病，在72小时内会导致呼吸停止发生，也可以导致女性轻微的神经病和麻痹。
3、长期剧烈的疼痛
已经发现疱疹发生在女性比男性会持续更长的时间。如果这是是第一次爆发会很痛苦，特别是女性，女性患有疱疹除了在生殖器区域如外阴、阴道内、子宫颈和尿道，而且它也可以发生在大腿等领域，这给患者造成尴尬。
4、怀孕期间会传染给孩子
最常见副作用的危险就是疱疹感染，就是该病毒从母亲传给她的孩子，如果母亲是首次遭受感染，是最有可能通过HSV病毒传染给她的孩子，这种感染可能导致早产，婴儿死亡，出生时脑损伤，天生严重皮疹或眼睛的问题。
5、增加艾滋病感染的可能性
很多人都不知道，让人谈之色变的艾滋病也与我们生活中频繁发生的生殖器疱疹有着很大的关系。专家提醒，患有生殖器疱疹的人群会增加艾滋病病毒感染的危险性，因此一旦发现患有生殖器疱疹等情况，就应该进行及时有效的治疗，以此来降低艾滋病病毒的感染(yiQIg.cN)。
6、容易导致系统疾病
生殖器疱疹所携带的病毒对人体而言危害非常的大，在研究中发现，这种病毒会侵犯内脏神经系统。因此而导致人体出现有胃肠道、泌尿道症状，除此之外它还会侵犯腹膜、胸膜，并且还会因此而引起刺激，甚至积液等症状，无论是哪种症状对人体健康而言都非常的不利。
7、导致宫颈癌
现如今患有宫颈癌的女性越来越多，这是由于宫颈癌的发病率升高所导致，而导致宫颈癌的原因有很多，其中最常见最频繁的生殖器疱疹就是其中的诱发原因之一。专家提醒生殖器疱疹如果不进行及时有效的治疗的话，势必会导致宫颈癌的发生。在一项研究报告中也指出，疱疹病毒与宫颈癌发生关系密切，同时在研究中宫颈癌患者中hsv-2的抗体阳性率明显高于正常人群，这就是导致宫颈癌的主要原因。