1内分泌异常
男性正常生精功能依赖于下丘脑—垂体—性腺轴功能的正常，其中任何一环节障碍，都会影响生精功能，其它如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。
2隐睾
有研究报道，单侧隐睾患者约有30%～60%不育，双侧隐睾则有50%～100%发生不育，少精症中隐睾患者约占9%。隐睾本身除了曲细精管退化影响生精之外，另一侧下降完全的睾丸也可能有不同程度的损害，原因可能是由于隐睾产生的抗精子抗体对正常睾丸的影响。
3泌尿生殖系统炎症
包括睾丸炎、附睾炎、精囊炎、前列腺炎、尿道炎等，这类患者在少精症中比例最多。泌尿生殖道的炎症可以直接影响睾丸生精功能，还可以使血液或者精液中产生抗精子抗体，影响精液的酸碱度，加上病原体对精子的直接杀伤作用，可造成精子减少(yiqig.cn)。
4精索静脉曲张
精索静脉曲张导致的不育症占男性不育的30%～40%。由于睾丸温度升高及毒素淤积等原因使睾丸生精功能受到影响，引起少精症，严重的可造成无精症。精索静脉曲张初起症状不明显，病情重者可感觉阴囊部坠胀，上面突起如蚯蚓状血管团。精液检查可见，精子数量下降，活动度差，畸形精子数增多。
5阴囊温度过高
睾丸中专门用来制造精子的曲精管对温度变化非常敏感，这个部位适宜温度比人体体温要低2～3℃，温度过高容易抑制精子的生存和成熟，造成精液中精子数量减少或活动能力降低。因此，男性朋友应少穿紧身裤，少洗桑拿浴，避免电磁辐射和高温，养成良好的生活习惯。