蔬菜、水果的消毒方法，必须效果可靠，对人体无害，使用方便，而又不造成营养素损失。
水果虽然大多生长在树上，但因使用农药和在摘取、包装、运输、销售过程中的损坏，往往会被污染，其污染程度与水果的表皮是否破损有关。表皮破损的水果，细菌污染率较高，如不好好消毒，常易导致肠道传染病的发生。
消毒水果最好的方法是沸水(快速)消毒法，简便经济，效果又好。操作过程是先用肥皂将水果刷净，再用自来水冲洗，然后放入沸水中充分浸泡，时间约30秒钟，最后削皮。某些水果如葡萄、草莓、杨梅等无法用肥皂清洗，则可用自来水漂洗后再用高锰酸钾溶液浸泡，高锰酸钾溶液的浓度以配成淡红色为度。浸泡10分钟后，取出用冷开水冲洗干净即可食用。如果没有高锰酸钾，用浓盐水浸泡亦可。
水生植物，如红菱和荸荠等都有可能被姜片虫囊幼污染，不宜生食，应该洗净后煮熟。由刀切开食用的水果，如西瓜，也应将外皮用肥皂冼净，才好用消过毒的水果刀切开，万勿将切菜刀公用。
蔬菜冷拌要注意卫生。常吃的有海带、芹菜、番茄等，先要充分洗净，然后用沸水烫过。切菜要用切熟食的刀具和砧板。拌时加少许醋，具有消毒作用。番茄生吃，还要剥皮、去子、加糖，待入味后食用。操作人员的手一定要用肥皂洗净，保证清洁卫生。