南瓜的可食部分达到80%以上。它皮薄肉厚，味道甜美，既可作为蔬菜(蔬菜食品)食用，又能长期储存以代替粮食，是一种救荒佳品。近年的食疗和药用价值，它几乎全身都可作药用。
南瓜花焙干研末，用麻油(油食品)调抹可治头疮、痈疽，未溃者用白酒调敷，有消肿及镇痛的功效。南瓜子洗净炒熟研末，用蜂蜜(蜂蜜食品)调开水冲服，可驱蛔虫、姜片虫、绦虫。美国农业部的研究人员发现，每天食用一把炒南瓜子，能使前列腺肥大患者的尿液减少并明显减轻尿频、尿急症状。
南瓜肉含有丰富的钴，可以增加体内胰岛素的释放，促使糖尿病(糖尿病食品)病人胰岛素分泌正常，以降低血糖(血糖食品)。
南瓜瓤有清热利湿及解毒作用，适用于烧伤、烫伤、弹片及异物入肉未出等外科伤痛。有这样一则传说可作佐证：有一次，许世友率领部队与日寇展开肉搏战，臂部被刺刀扎伤，伤口很大。战斗结束后，因没有医生，他就弄了一团南瓜瓤塞入伤口、扎好。