据有关专家介绍，漱口水可分为保健型和治疗型两大类。但无论是保健型还是治疗型漱口水，都会有一些使用中的注意事项，如果未在医生指导下长期大量使用，可能引起口腔菌群失调。
有些漱口水含有葡萄糖酸氯已定，这种物质是容易影响口腔黏膜的，让口腔粘膜变厚，使味蕾的味觉降低，不仅损伤味觉，还会抑制唾液的分泌造成口干。
漱口水最好不要用得太过频繁，而且不要觉得对所有人来说都是直接漱更好，其实对于健康人群在漱口时应先用清水漱口，将清水含在口内，鼓动两腮与唇部，使清水在口腔内能充分与牙齿、牙龈接触，并利用水力反复地冲洗口腔各个部位。
这样就尽可能清除掉存留在牙齿的小窝小沟、牙间隙、牙龈、唇颊沟等处的食物残渣和软垢，这样为口腔适应漱口水创造条件。再含上约10毫升的漱口水，用上述方法漱1分钟，起到清洁和杀菌，巩固牙齿健康的作用。
在使用漱口水之后，再用清水漱一下，这样可以去除口腔中残留的漱口水残液。